Streszczenie Rozprawy Doktorskiej W Języku Polskim.pdf

Sarkoidy są jednymi z najczęściej diagnozowanych nowotworów skóry u koni, a ich głównym czynnikiem etiologicznym są wirusy brodawczaka bydła (BPV). Badanie histologiczne jest obecnie najbardziej niezawodną metodą diagnostyczną, ale jest czasochłonne i wymaga stosowania rozpuszczalników organicznych. Dlatego poszukiwane są nowe strategie diagnostyczne, które umożliwią szybką i precyzyjną diagnostykę schorzenia.

Celem pracy doktorskiej było zbadanie profilu metylacji genów o potencjalnym znaczeniu diagnostycznym i/lub prognostycznym w sarkoidach końskich. Analiza metylacji DNA wykazała, że nie ma różnic w poziomie metylacji DNA oraz ekspresji analizowanego panelu dziewięciu genów kandydujących pomiędzy tkanką guza a tkanką kontrolną.

Jednak porównawcza analiza metylacji frakcji genomu bogatej w dinukleotydy CpG wykazała 136 regionów wykazujących różnice w poziomie metylacji miejsc CpG (DMR) pomiędzy sarkoidem a tkanką zdrową. Większość zidentyfikowanych DMR stanowiły niewielkie fragmenty, zlokalizowane w rejonach międzygenowych, oddalonych od miejsc startu transkrypcji.

Przeprowadzona analiza profilu metylacji wybranych DMR na większej grupie badawczej wykazała istotne różnice w poziomie metylacji DNA pomiędzy tkanką zdrową i chorą, w obrębie genów RALGPS1, C1orf106 oraz EFEMP2. Wyniki te wskazują na występowanie zależności pomiędzy hipometylacją tego regionu a nadekspresją SPARC w tkance sarkoidów.

Uzyskane wyniki analizy transkryptomu sarkoidów końskich umożliwiły identyfikację 901 genów wykazujących istotne różnice w poziomie ekspresji w tkance guza w odniesieniu do tkanki zdrowej. Wyniki te mogą stanowić podstawę do opracowania nowych alternatywnych podejść diagnostycznych oraz terapeutycznych, mających na celu przywrócenie prawidłowego funkcjonowania genów, których aktywność uległa zaburzeniu związanym z etiologią powstawania sarkoidów.